Masker medis sekali pakai biasanya terdiri dari tiga lapisan kain bukan tenunan, dengan masing-masing lapisan memiliki tujuan tertentu. Masker medis biasanya terbuat dari tiga lapisan kain bukan tenunan, dengan lapisan luar dan dalam bersifat hidrofobik, dan lapisan tengah berfungsi sebagai filter.Lapisan luar masker medis sekali pakai biasanya terbuat dari bahan hidrofobik (anti air). Ini berfungsi sebagai penghalang untuk menolak air, tetesan, dan cairan lainnya, sehingga membantu mencegah penetrasi partikel yang berpotensi menularkan dari luar.
Sifat hidrofobik pada lapisan luar sangat penting dalam menghalangi tetesan besar dan percikan yang mungkin mengandung bakteri, virus, dan zat berbahaya lainnya. Saat seseorang yang memakai masker batuk, bersin, atau berbicara, tetesan pernapasan yang mengandung partikel tersebut dapat terlepas ke udara. Lapisan luar hidrofobik bertindak sebagai pelindung, mencegah tetesan yang lebih besar bersentuhan dengan lapisan dalam masker, yang bertanggung jawab untuk filtrasi dan penyerapan.
Dengan mencegah penetrasi cairan eksternal, lapisan luar juga membantu menjaga lapisan filter tengah tetap kering, sehingga menjaga efisiensi filtrasinya. Masker basah kurang efektif dalam menyaring partikel dan dapat mengurangi kemampuannya dalam melindungi pemakainya dan orang lain.